秘密佛教各派，尽管不是从一个统一的模式中分化衍生而来，各自兴起的地方也有所不同，流行的时间有先有后，所受的影响也大不一样。但纵观整个历史发展的过程，各派之间有内在的相互联系和前后的相承接续关系，这不仅表现在密法上的逐渐完善和发展，而且还表现在哲学思想上的承袭和演变。
再者，后来各派所讲的五部，亦是从《大日经》的三部五佛演化而来。甚至后来各派强调众生与佛的同一性和�茪�别性，视贪染为净菩提，在修行实践中重视体证莲花与金刚的合二为一的原理，都是导源于《大日经》即心是佛、自心自觉的一元论思想。这一思想自从《大日经》论证阐明之后，一直贯串于各派密教思想之中，是密教哲学思想的主要倾向。
另外，《大日经》还确立了密教的信仰体系和神灵体系，其中如大日如来被奉为秘密佛教至高�茪W的主尊和教主，并赋予法身佛的意义，从现有数据看是始自于《大日经》的。
所以，《大日经》在整个秘密佛教中也占有十分重要的地位，对于研究秘密佛教学说的发展和研究秘密佛教同大乘佛教的关系，都具有重要的意义。《大日经》还以一章的篇幅专门阐明论证了密教的基本教义，与其它只偏重于密法仪轨的密典相比，更具有较强的理论和哲学色彩，因而也被大乘各派各宗所看重，在显教中具有一定的影响。
又《大日经》兼收中观、瑜伽二派的思想以建立自己的佛教学说，因而在一定程度上反映了二派在当时的影响。《大日经》中也较多地反映了当时及其以前印度其他各宗教和哲学派别的观点，这就对研究当时的佛教和其他各教各派的思想，具有一定的参考价值。
《大日经》汉译正文三十一品，本着所选即其中第一品〈入真言门住心品〉，和第二品〈入漫荼罗具缘真言品〉。之所以节选这两品，是因为这两品具有典型性，是该经的精要部分，可以代表该经。
《大日经》从内容上可分为两大部分，第一大部分即第一品，讲述该经的基本教义，统论全经大意。第二大部分即第二品及其以后各品，讲述胎藏界密法及其修行的各种仪轨。
其中第二品集中讲述该经的主要密法大悲胎藏生大漫荼罗法，是第二大部分的精要，把其余各品可以看作是对该品的补充和扩大，所以此品可以代表第二大部分的主要内容。一行《大日经疏》共二十卷，其中有近九卷注释第一品和第二品，足见作者对此两品之重视。
《大日经》汉译本共七卷三十六品，其中第七卷最后五品为善�茯𧘇壯@《大毘卢遮那经供养次第法》，故《大日经》正文实为六卷三十一品。藏译本共两编三十六品，其中外编七品中的前五品为护摩法，后两品为持诵法和如来生漫荼罗加持法，故内编正文实为二十九品，其内容与汉译本正文相当，仅品目的设立和前后顺序及文字有所差异。
具体来说，藏译第十三品为汉译第十四品，藏译第十四品为汉译第十三品。藏译第七、八、九品为汉译第二十八、二十九、三十品，藏译第六品即为汉译第六、七品，藏译第二十七品即为汉译第二十七、三十一品。
按汉译本，第三〈息障品〉主要讲如何消除择地造坛、受职灌顶时出现的障碍，以及不动明王法。
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